在PDA培养基上，菌落初淡灰色，后褐色。 菌丝体棉絮状、蛛丝状，有隔，直径8～12μm，分枝呈直角，分枝处缢缩，离分枝处不远有一隔膜，以后菌丝变为淡褐色，分枝与隔膜增多。 老熟菌丝深褐色。老熟菌丝常形成成串的桶形细胞、逐渐聚集交织形成菌核，菌核无定形，大小不等，淡褐色至黑色，质地疏松，表面粗糙，大小如油菜籽，紧贴病部表面。病菌不产生无性孢子。

发病部位主要在幼苗的茎基部，距土表3～6cm的干湿土交界处。发病初期，茎基部呈现黄褐色的凹陷长斑，被害组织逐渐腐烂、缢缩。严重时，病斑深入茎内，环绕整个茎基部，破坏输导组织，致使幼苗倒状、枯萎死亡。出土前遭受侵染，小苗不易出土，幼芽在土中即烂掉。在田间，中心病株出现后，迅速向四周蔓延，幼苗成片死亡。病部及周围土壤常见有菌丝体。